根据中心主要职责，设8个内设机构3个分中心：办公室、计划财务科、人事科、养护科、巡查科、安全监督科、党委办公室室、纪检监察室；尚志分中心、牡丹江分中心、佳木斯分中心。各部门职责任务是：

  1、办公室

  负责中心日常运转工作，承担文电、会务、机要、信息、安全、保密、档案、信访维稳、后勤服务等工作。承担中心资产维护、联络接待、综合协调、督察督办、普法宣传教育等工作。

  2、计划财务科